Основная тематика научно-исследовательской деятельности направлена на изучение и выработку практических рекомендаций в области экономики и эксплуатации всех видов транспорта, строительства, текущего содержания и ремонта инфраструктуры, прежде всего, пути, дорог, трубопроводов и наземного подвижного состава, водного и воздушного транспорта, средств доставки, внедрения информационных технологий, устройств СЦБ и связи, перспектив развития транспортной сети, вопросов развития транспортных коридоров и транзитного потенциала Центральной Азии и окружающих стран.